================================================================================ DATOS DE REFERENCIA (ref.h5) Contiene perfiles de expresion por tipo celular ================================================================================ ============================================================ [ref_bulkRNA] ============================================================ Keys disponibles: ['cell_types', 'data', 'genes'] Shape de 'data': (5, 15908) dtype: float64 Head 10 filas x 10 columnas: [[ 0.1067 1.1912 0. 35.4402 0.854 0. 16.6968 25.1444 43.0549 0.0621] [ 10.2768 3.842 0.0439 17.2709 0.7308 0.5718 29.177 46.1862 32.8158 0.0472] [ 6.1943 2.89 0.0336 556.1129 3.8814 0.3393 21.7829 47.3248 15.7132 0.0334] [ 0.1617 0.0156 34.3816 0.2026 0.1513 0.0405 0.4523 31.7388 50.0431 22.0534] [ 0.0858 0. 0.5245 0.0303 0.3371 15.2452 28.5914 36.3355 38.1918 17.1763]] Genes (primeros 10): ['A1BG', 'A1BG-AS1', 'A1CF', 'A2M', 'A2M-AS1', 'A2ML1', 'A4GALT', 'AAAS', 'AACS', 'AADAC'] Total genes: 15908 cell_types: ['endo', 'fibro', 'immune', 'classic', 'basal'] Total cell_types: 5 ============================================================ [ref_met] ============================================================ Keys disponibles: ['CpG_sites', 'cell_types', 'data'] Shape de 'data': (5, 23724) dtype: float64 Head 10 filas x 10 columnas: [[0.6112 0.0668 0.1155 0.0512 0.8926 0.0884 0.0665 0.9092 0.0818 0.0655] [0.6811 0.1211 0.1384 0.0637 0.9232 0.1114 0.0854 0.9193 0.0884 0.0888] [0.8987 0.2514 0.1089 0.0865 0.9144 0.1738 0.115 0.8997 0.1028 0.0914] [0.0596 0.0977 0.1205 0.0572 0.9132 0.1013 0.0732 0.9135 0.0842 0.0852] [0.048 0.0822 0.0988 0.0518 0.9027 0.1059 0.0697 0.9201 0.0683 0.0702]] cell_types: ['endo', 'fibro', 'immune', 'classic', 'basal'] Total cell_types: 5 ============================================================ [ref_scRNA] ============================================================ Keys disponibles: ['ref_sc_baron', 'ref_sc_peng', 'ref_sc_raghavan']